飼料原子吸收分光光度計根據郎伯-比爾定律來確定樣品中化合物的含量。已知所需樣品元素的吸收光譜和摩爾吸光度，以及每種元素都將優先吸收特定波長的光，因為每種元素需要消耗一定的能量使其從基態變成激發態。檢測過程中，基態原子吸收特征輻射，
飼料原子吸收分光光度計通過測定基態原子對特征輻射的吸收程度，從而測量待測元素含量。
原子吸收是指呈氣態的原子對由同類原子輻射出的特征譜線所具有的吸收現象。當輻射投射到原子蒸氣上時，如果輻射波長相應的能量等于原子由基態躍遷到激發態所需要的能量時，則會引起原子對輻射的吸收，產生吸收光譜。基態原子吸收了能量，zui外層的電子產生躍遷，從低能態躍遷到激發態。
在飼料原子吸收分光光度計中，總的來說干擾是較小的。這是由方法本身的特點所決定的。在飼料原子吸收分光光度計中，使用的是銳線光源，應用的是共振吸收線，吸收線的數目比發射線數目少得多，在原子吸收分析中譜線重疊的概率是較小的。但個別仍有可能產生譜線重疊而引致干擾。下表列舉了由于共振線重疊而引起干擾的一些例子。由于大部分元素都具有好幾條分析線，因此大都可選用其他譜線而避免干擾，或用分離干擾元素的方法來解決。
飼料原子吸收分光光度計是利用原子或者離子外層電子對特定波長的光可以吸收，從而發生能級躍遷的原理。因為不同原子或者離子的不同的電子躍遷要吸收特定波長的光，所以發射光經過分光以后形成的單色光如果被吸收，則溶液中含有特定的原子或者離子。吸收的強度可以用來標定溶液的濃度。
